El médico Eufemiano Fuentes, uno de los acusados de la Operación Puerto, se ha negado a contestar a las acusaciones, salvo a la Fiscalía y a la Abogacía del Estado, con lo que ha eludido las preguntas más directamente relacionadas con prácticas de dopaje en el ciclismo.
Éstas son algunas de las cuestiones planteadas por los abogados de la Agencia Mundial Antidopaje, la Unión Ciclista Internacional, la Federación Española de Ciclismo, la Asociación Internacional de Grupos Ciclistas Profesionales, el Comité Olímpico Italiano y el exciclista Jesús Manzano a las que Fuentes no ha respondido acogiéndose a su derecho a no declarar:
- "¿Por qué si todos sus clientes eran ciclistas profesionales acudían a usted cuando disfrutaban de tratamiento médico gratuito en sus equipos?"
- "¿Por qué, si las transfusiones eran legales, todos ellos decidieron que sus muestras fueran identificadas mediante apodos y ninguno quiso poner su nombre y apellidos?"
- "¿Por qué si el único tratamiento que se daba a la sangre era congelarla en ocho muestras aparecieron niveles de EPO más elevados de lo normal?"
- "¿Dónde consta el consentimiento de los deportistas y que recibieron información sobre los riesgos del tratamiento?"
- "¿Por qué se utilizaban códigos y motes que podían crear confusión para identificar las muestras?"
- "¿Por qué todos sus clientes pertenecían a equipos en competición?"
- "¿Cómo publicitaba sus servicios? ¿Cómo conocían los deportistas que hacía esas autotransfusiones?"
- "¿Correspondían algunos de los símbolos que figuran en la documentación -puntos, círculos, conjuntos vacíos...- a sustancias como EPO, insulina o anabolizantes?"
- "¿Por qué siempre hablaban en clave si sus actividades eran lícitas?"
Los abogados de las acusaciones han hecho constar asimismo que entre las preguntas que Fuentes ha rechazado contestar había varias sobre el significado de términos utilizados en sus conversaciones como guerra (supuestamente, el Giro), Siberia (por el proceso de congelación), la firma o pizzería. También le iban a pedir que identificara a quienes correspondían apodos como Asterix (presuntamente, el propio Eufemiano), Obelix (presuntamente, Merino) o Birillo (presuntamente, el ciclista Iván Basso).